Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms