Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CALCOCO2Q13137 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CALCOCO2Q13137 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CALCOCO2Q13137 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CALCOCO2Q13137 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CALCOCO2Q13137 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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