Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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