Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms