Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 DCAF16-203ENST00000507768 757 ntTSL 217.08■□□□□ 0.329e-22■■□□□ 11.7
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SF3A3Q12874 TMX2-207ENST00000529403 1697 ntTSL 29.16□□□□□ -0.944e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TMX2-206ENST00000528110 829 ntTSL 28.36□□□□□ -1.074e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.124e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.214e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TMX2-208ENST00000530114 663 ntTSL 37.5□□□□□ -1.214e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.046e-7■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 TAF1D-219ENST00000534079 656 ntTSL 25.65□□□□□ -1.51e-11■■□□□ 11.6
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SF3A3Q12874 HNRNPH3-203ENST00000461310 648 ntTSL 57.32□□□□□ -1.241e-6■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 HNRNPH3-209ENST00000486854 635 ntTSL 25.32□□□□□ -1.561e-6■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 SRRM2-225ENST00000576076 914 nt15.94■□□□□ 0.142e-16■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 SRRM2-209ENST00000572278 711 ntTSL 29.81□□□□□ -0.842e-16■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 SRRM2-215ENST00000573498 994 ntTSL 34.91□□□□□ -1.622e-16■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 C16orf70-206ENST00000567162 695 ntTSL 53.69□□□□□ -1.824e-8■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 AL662899.3-203ENST00000409691 1903 ntTSL 314.39□□□□□ -0.112e-8■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 AL662899.3-202ENST00000617558 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-8■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 NOTUM-202ENST00000425009 996 ntTSL 321.17■□□□□ 0.983e-12■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.32e-9■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-203ENST00000470714 868 ntTSL 315.58■□□□□ 0.081e-9■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.21e-9■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 STAG3L5P-206ENST00000488972 552 ntTSL 411.59□□□□□ -0.551e-9■■□□□ 11.6
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SF3A3Q12874 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-205ENST00000483329 819 ntTSL 510.82□□□□□ -0.681e-9■■□□□ 11.6
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SF3A3Q12874 EEF1D-228ENST00000529832 600 ntTSL 416.34■□□□□ 0.219e-8■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 EEF1D-209ENST00000524900 343 ntTSL 515.25■□□□□ 0.039e-8■■□□□ 11.6
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SF3A3Q12874 EEF1D-245ENST00000532596 761 ntTSL 413.26□□□□□ -0.299e-8■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 EEF1D-231ENST00000530306 583 ntTSL 213.19□□□□□ -0.39e-8■■□□□ 11.6
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SF3A3Q12874 EEF1D-254ENST00000534475 538 ntTSL 411.71□□□□□ -0.539e-8■■□□□ 11.6
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SF3A3Q12874 EEF1D-255ENST00000534804 555 ntTSL 47.49□□□□□ -1.219e-8■■□□□ 11.6
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SF3A3Q12874 IDH3B-211ENST00000492240 964 ntTSL 510.02□□□□□ -0.815e-9■■□□□ 11.6
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SF3A3Q12874 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.022e-6■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.322e-6■■□□□ 11.6
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SF3A3Q12874 MLXIPL-208ENST00000456640 706 ntTSL 515.67■□□□□ 0.11e-12■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 PCNX3-204ENST00000531045 266 ntTSL 315.08■□□□□ 07e-7■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.046e-8■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.086e-8■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 NOP2-208ENST00000537708 598 ntTSL 414.43□□□□□ -0.16e-8■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 NOP2-213ENST00000542015 1002 ntTSL 314.39□□□□□ -0.116e-8■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 NOP2-217ENST00000544630 657 ntTSL 313.57□□□□□ -0.246e-8■■□□□ 11.6
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SF3A3Q12874 NOP2-201ENST00000322166 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.396e-8■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 NOP2-223ENST00000620535 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.416e-8■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 NOP2-218ENST00000545200 2751 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.666e-8■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 NOP2-207ENST00000537442 2613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.686e-8■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 NOP2-202ENST00000382421 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.696e-8■■□□□ 11.6
SF3A3Q12874 NOP2-206ENST00000536506 889 ntTSL 59.16□□□□□ -0.946e-8■■□□□ 11.6
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SF3A3Q12874 COL27A1-208ENST00000494780 514 ntTSL 419.57■□□□□ 0.722e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.62e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 SRSF11-210ENST00000469170 668 ntTSL 218.43■□□□□ 0.542e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 ACSS2-205ENST00000467019 504 ntTSL 418.25■□□□□ 0.512e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 KIF1C-204ENST00000574165 799 ntTSL 517.92■□□□□ 0.466e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.462e-7■■□□□ 11.5
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SF3A3Q12874 SNX17-206ENST00000484886 568 ntTSL 217.29■□□□□ 0.362e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.232e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.22e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.072e-7■■□□□ 11.5
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SF3A3Q12874 NDUFA11-204ENST00000591341 403 ntTSL 214.2□□□□□ -0.145e-14■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 ARMC5-208ENST00000570119 723 ntTSL 313.99□□□□□ -0.172e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 ACSS2-215ENST00000481971 570 ntTSL 413.79□□□□□ -0.22e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 RARS-208ENST00000522834 559 ntTSL 513.78□□□□□ -0.22e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.382e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 PRMT7-211ENST00000563608 626 ntTSL 512.61□□□□□ -0.392e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 RANGAP1-205ENST00000446258 759 ntTSL 312.33□□□□□ -0.442e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 DHRS1-207ENST00000559483 629 ntTSL 312.13□□□□□ -0.472e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 RARS-207ENST00000521939 678 ntTSL 211.9□□□□□ -0.52e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 RARS-206ENST00000521329 581 ntTSL 411.88□□□□□ -0.512e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 DCAF12-201ENST00000361264 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 EIF4G1-235ENST00000482303 493 ntTSL 211.66□□□□□ -0.542e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 ACSS2-209ENST00000475459 558 ntTSL 411.51□□□□□ -0.572e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 RARS-201ENST00000231572 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.592e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.62e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 ACSS2-206ENST00000468550 547 ntTSL 510.94□□□□□ -0.662e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 PLEKHA1-202ENST00000368989 3771 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.722e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 ATP13A1-203ENST00000455627 554 ntTSL 410.17□□□□□ -0.782e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 DCAF12-202ENST00000396990 803 ntTSL 39.58□□□□□ -0.882e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 KDM6B-204ENST00000571047 362 ntTSL 58.78□□□□□ -12e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 CEP250-210ENST00000465987 380 ntTSL 38.11□□□□□ -1.112e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 ACSS2-217ENST00000488172 648 ntTSL 47.98□□□□□ -1.132e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 SNX17-207ENST00000489402 743 ntTSL 27.86□□□□□ -1.152e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 DCAF12-203ENST00000450964 676 ntTSL 57.71□□□□□ -1.182e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.192e-7■■□□□ 11.5
SF3A3Q12874 ACSS2-204ENST00000464399 358 ntTSL 56.93□□□□□ -1.32e-7■■□□□ 11.5
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