Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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