Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF5Q12774 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms