Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPAQ06546 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms