Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
OC90Q02509 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
OC90Q02509 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
OC90Q02509 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
OC90Q02509 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
OC90Q02509 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms