Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms