Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms