Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX1P78337 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX1P78337 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms