Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RPS29P62273 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RPS29P62273 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RPS29P62273 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RPS29P62273 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RPS29P62273 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms