Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms