Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSCP56915 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms