Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN15P56746 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CLDN15P56746 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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