Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms