Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA5P52803 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms