Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC004918.3-201ENST00000602609 925 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms