Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms