Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms