Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP13P45452 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP13P45452 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP13P45452 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP13P45452 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP13P45452 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP13P45452 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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