Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms