Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms