Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms