Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms