Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPREP23469 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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