Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA4P22748 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA4P22748 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA4P22748 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA4P22748 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA4P22748 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CA4P22748 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA4P22748 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA4P22748 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms