Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHP20396 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHP20396 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms