Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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