Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDGFRAP16234 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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