Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms