Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms