Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI3P10071 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI3P10071 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI3P10071 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms