Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms