Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR5O60602 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR5O60602 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR5O60602 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR5O60602 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR5O60602 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR5O60602 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR5O60602 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR5O60602 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR5O60602 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR5O60602 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR5O60602 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms