Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGTAO43765 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGTAO43765 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGTAO43765 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGTAO43765 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGTAO43765 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGTAO43765 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGTAO43765 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGTAO43765 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGTAO43765 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGTAO43765 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms