Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARHGEF10O15013 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms