Protein–RNA interactions for Protein: O14524

NEMP1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP1O14524 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP1O14524 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms