Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF10AO00220 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms