Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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