Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms