Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC096677.3-201ENST00000413162 387 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms