Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC162PA2VCL2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms