Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms