Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms