Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIMS3Q9UJD0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms