Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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