Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms