Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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